Tomskas pilsētas veidošanās sākās tālajā 1604. gadā, kad netālu no Toma upes tika uzcelts cietoksnis. Pats Boriss Godunovs svētīja jaunās pilsētas celtniecību un par godu tam nosūtīja Svētās Trīsvienības attēlu. Topošās pilsētas Tomskas centrā sākās jaunas baznīcas celtniecība. Un no šī brīža pilsētnieku pareizticīgā dzīve sāk augt un attīstīties. Tomskā tiek celti daudzi tempļi, kapelas un baznīcas.
Sv. Trīsvienības baznīca
Vairāk nekā 150 gadus Voskresenskas kalnā stāv iesvētītā Trīsvienības baznīcas ēka. Tas tika uzcelts un izgaismots 1844. gadā.
Pagājušā gadsimta grūtajos četrdesmitajos gados aizmugures baznīcas tika nodotas no rokas rokā. Vispirms 1939. gadā tur atradās garāža, nedaudz vēlāk vietējās maizes ceptuve. Pēc kara beigām, 1945. gadā, templis tika atdots ticīgajiem, un 1946. gada februārī baznīca tika atkārtoti iesvētīta. Tomskas Trīsvienības baznīcas atjaunošanas darbi tika veikti par draudzes locekļu līdzekļiem. Draudze darbojas līdz šai dienai, tā darbojasSvētdienas skola un bibliotēka.
Augšāmcelšanās baznīca
Tomskas baznīcu vidū šī ir viena no senākajām. Tas ir praktiski vienā vecumā ar pilsētu. Sākotnēji klostera teritorijā 1644. gadā tika uzcelta koka baznīca. 1789. gadā tika likti pamati jaunai divstāvu baznīcai. Pēc jaunās ēkas būvniecības pabeigšanas vecā koka baznīca pēc pareizticīgo paražas tika nodedzināta un izkaisīta vējā. Tāpat kā daudzas Tomskas baznīcas, pagājušā gadsimta 30. gadu otrajā pusē templis tika slēgts, un tikai 1995. gadā tas tika atkārtoti iesvētīts un pareizticīgie atkal varēja apmeklēt dievkalpojumus.
Znamenskas baznīca
Baznīca nosaukta Dievmātes ikonas "Zīme" vārdā. Sākotnēji tas bija vienkāršs koka templis, kas celts 17. gadsimtā. Akmens tempļa celtniecība sākās 1784. gadā par baznīcas dibinātāju uzskatītā Ivana Kačalova pēcteču kačalovu muižniecības līdzekļiem. 1935. gadā baznīca tika nopostīta un atjaunota tikai 1992. gadā par draudzes locekļu līdzekļiem.
Pētera un Pāvila baznīca
Vienā no pakalniem, kas nolaižas līdz Ušaikas upes palienei, ko vietējie iedzīvotāji sauca par Muhin Hillock, agrāk atradās krusts un kapliča. Vēlāk šajā vietā tika uzcelta Pētera un Pāvila katedrāle. Baznīca tika iesvētīta 1911. gadā. 1938. gadā dievkalpojumi tika pārtraukti, un baznīcas teritorijā atradās spirta rūpnīcas noliktava. Taču jau 1945. gadā baznīca atgriezās ierastajā rutīnā. Pētera un Pāvila baznīca ir viena no retajām Tomskas baznīcām, kas turpināja uzņemt draudzes locekļus 50.-90. XX gadsimta gadi.
Māja baznīca Svētā Nikolaja Brīnumdarītāja vārdā
90. gadu sākumā uz psihiatriskās slimnīcas bāzes tika uzcelta un izgaismota viena no Tomskas pilsētas baznīcām, kas nosaukta Svētā Nikolaja Brīnumdarītāja vārdā. Sākotnēji tā tika būvēta pēc noteiktas koncepcijas, proti, Kunga garīgo spēku un medicīnas dziedinošo līdzekļu mijiedarbības, palīdzot garīgi slimajiem. Taču ideoloģiskā puse tika zaudēta 1920. gadā, kad baznīca tika slēgta. Deviņdesmito gadu beigās atkal parādījās ideja par baznīcas atvēršanu slimnīcā. Kopš 2003. gada šeit ir uzsākti restaurācijas darbi. Šobrīd ticīgie no slimo un medicīnas darbinieku vidus uz dievkalpojumu nāk ar prieku.
Radoņežas Sv. Sergeja baznīca
Šī ir jaunākā no Tomskas baznīcām. Baznīcas dibinātājs ir gulšņu impregnēšanas rūpnīcas direktors G. I. Trigorlovs. Ieraudzījis vienu no Jaroslavļas kapelām, viņš bija tik sajūsmā par tās krāsu, ka sāka būvēt tādu pašu baznīcu savā dzimtajā pilsētā. Pēc G. I. Trigorlova personīgā projekta templis tika uzcelts un iesvētīts 1997.gadā.
Epifānijas katedrāle
Sākotnēji, 1630. gadā, tā bija neliela Epifānijas baznīca. Daudz vēlāk tā saņēma katedrāles statusu. Koka baznīca bieži cieta ugunsgrēkos, taču katru reizi tā tika atjaunota. 1777. gadā vecās koka ēkas vietā tika nolemts uzcelt modernu mūra ēku. 30. gados templis tika slēgts, un tā sienās atradās apavu fabrika. Ēka tika atsavināta 1997. gadā. Krievijas pareizticīgo baznīcu un sāka darbu pie tās atjaunošanas.
